7E18

Crystal structure of SAR-CoV-2 3CL protease complex with inhibitor YH-53

7E18 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb7e18/pdb
• 分子名称: Replicase polyprotein 1ab, N-[(2S)-1-[[(2S)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxidanylidene-3-[(3S)-2-oxidanylidenepyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-4-methoxy-1H-indole-2-carboxamide, 1,2-ETHANEDIOL, ... (4 entities in total)
• 機能のキーワード: sars-cov-2 3cl protease, hydrolase
• 由来する生物種: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV)
• タンパク質・核酸の鎖数: 1
• 化学式量合計: 34835.70

構造登録者

Senda, M.,Konno, S.,Hayashi, Y.,Senda, T. (登録日: 2021-02-01, 公開日: 2021-06-23, 最終更新日: 2023-11-29)

• 主引用文献: Konno, S.,Kobayashi, K.,Senda, M.,Funai, Y.,Seki, Y.,Tamai, I.,Schakel, L.,Sakata, K.,Pillaiyar, T.,Taguchi, A.,Taniguchi, A.,Gutschow, M.,Muller, C.E.,Takeuchi, K.,Hirohama, M.,Kawaguchi, A.,Kojima, M.,Senda, T.,Shirasaka, Y.,Kamitani, W.,Hayashi, Y.; 3CL Protease Inhibitors with an Electrophilic Arylketone Moiety as Anti-SARS-CoV-2 Agents.; J.Med.Chem., 65:2926-2939, 2022; PubMed: 34313428; DOI: 10.1021/acs.jmedchem.1c00665

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.65 Å)