7DGI
The co-crystal structure of SARS-CoV-2 main protease with peptidomimetic inhibitor N-((S)-3-methyl-1-(((S)-4-methyl-1-oxo-1-(((S)-1-oxo-3-((S)-2-oxopiperidin-3-yl)propan-2-yl)amino)pentan-2-yl)amino)-1-oxobutan-2-yl)-4-nitrobenzamide
7DGI の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb7dgi/pdb |
分子名称 | 3C-like proteinase, ~{N}-[(2~{S})-3-methyl-1-[[(2~{S})-4-methyl-1-oxidanylidene-1-[[(2~{S})-1-oxidanylidene-3-[(3~{S})-2-oxidanylidenepiperidin-3-yl]propan-2-yl]amino]pentan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]-4-nitro-benzamide (3 entities in total) |
機能のキーワード | complex, inhibitor, hydrolase |
由来する生物種 | Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (2019-nCoV) |
タンパク質・核酸の鎖数 | 2 |
化学式量合計 | 68714.30 |
構造登録者 | |
主引用文献 | Wang, H.,Pei, R.,Li, X.,Deng, W.,Xing, S.,Zhang, Y.,Zhang, C.,He, S.,Sun, H.,Xiao, S.,Xiong, J.,Zhang, Y.,Chen, X.,Wang, Y.,Guo, Y.,Zhang, B.,Shang, L. The structure-based design of peptidomimetic inhibitors against SARS-CoV-2 3C like protease as Potent anti-viral drug candidate. Eur.J.Med.Chem., 238:114458-114458, 2022 Cited by PubMed: 35635946DOI: 10.1016/j.ejmech.2022.114458 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.898 Å) |
構造検証レポート
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