6Q6X

Structure of Fucosylated D-antimicrobial peptide SB6 in complex with the Fucose-binding lectin PA-IIL at 1.525 Angstrom resolution

6Q6X の概要

関連するPDBエントリー6Q6W
分子名称Fucose-binding lectin, SB6, CALCIUM ION, ... (6 entities in total)
機能のキーワードantimicrobial, lectin, complex, antibiotic
由来する生物種Pseudomonas aeruginosa
詳細
ポリマー鎖数8
分子量合計53875.74
構造登録者
Baeriswyl, S.,Stocker, A.,Reymond, J.-L. (登録日: 2018-12-12, 公開日: 2019-03-20)
主引用文献
Baeriswyl, S.,Gan, B.H.,Siriwardena, T.N.,Visini, R.,Robadey, M.,Javor, S.,Stocker, A.,Darbre, T.,Reymond, J.L.
X-ray Crystal Structures of Short Antimicrobial Peptides as Pseudomonas aeruginosa Lectin B Complexes.
Acs Chem.Biol., 2019
PubMed: 30830745 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1021/acschembio.9b00047
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.525 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers 0.18130 0.3%0MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

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回転なし
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x軸(左右方向)周りに90°回転
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y軸(上下方向)周りに90°回転

他の静止画像(生物学的単位)

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x軸(左右方向)周りに90°回転
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y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (6q6x.pdb1.gz [43.59 KB])
生物学的単位の座標ファイル (6q6x.pdb2.gz [44.83 KB])
生物学的単位の座標ファイル (6q6x.pdb3.gz [43.91 KB])
生物学的単位の座標ファイル (6q6x.pdb4.gz [44.84 KB])