6NIB

Crystal Structure of Medicago truncatula Agmatine Iminohydrolase (Deiminase)

6NIB の概要

分子名称Porphyromonas-type peptidyl-arginine deiminase, GLYCEROL, SODIUM ION, ... (5 entities in total)
機能のキーワードpolyamine metabolism, putrescine biosynthesis, hydrolase
由来する生物種Medicago truncatula (Barrel medic)
ポリマー鎖数1
分子量合計41677.47
構造登録者
Sekula, B.,Dauter, Z. (登録日: 2018-12-27, 公開日: 2019-03-20)
主引用文献
Sekula, B.,Dauter, Z.
Structural study of agmatine iminohydrolase from Medicago truncatula, the second enzyme of the agmatine route of putrescine biosynthesis in plants
Front Plant Sci, 2019
DOI: 10.3389/fpls.2019.00320
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.2 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers 0.14030 0.3% 4.1%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (6nib.pdb1.gz [285.71 KB])