6KMP

100K X-ray structure of HIV-1 protease triple mutant (V32I,I47V,V82I) with tetrahedral intermediate mimic KVS-1

6KMP の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb6kmp/pdb
• 関連するBIRD辞書のPRD_ID: PRD_001037
• 分子名称: Protease, N~2~-[(2R,5S)-5-({(2S,3S)-2-[(N-acetyl-L-threonyl)amino]-3-methylpent-4-enoyl}amino)-2-butyl-4,4-dihydroxynonanoyl]-L-glutaminyl-L-argininamide (3 entities in total)
• 機能のキーワード: hiv-1 protease, tetrahedral intermediate, aids, viral protein, enzyme mechanism, oxyanion, neutron crystallography, hydrogen bonding, hyperconjugation, drug design
• 由来する生物種: Human immunodeficiency virus 1
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 22310.39

構造登録者

Das, A.,Kovalevsky, A. (登録日: 2019-07-31, 公開日: 2020-07-29, 最終更新日: 2023-11-22)

• 主引用文献: Kumar, M.,Mandal, K.,Blakeley, M.P.,Wymore, T.,Kent, S.B.H.,Louis, J.M.,Das, A.,Kovalevsky, A.; Visualizing Tetrahedral Oxyanion Bound in HIV-1 Protease Using Neutrons: Implications for the Catalytic Mechanism and Drug Design.; Acs Omega, 5:11605-11617, 2020; PubMed: 32478251; DOI: 10.1021/acsomega.0c00835

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.31 Å)