6E1T

Crystal structure of a class I PreQ1 riboswitch complexed with a synthetic compound 1: 2-[(dibenzo[b,d]furan-2-yl)oxy]ethan-1-amine

6E1T の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb6e1t/pdb
• 分子名称: RNA (33-MER), 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, 2-[(dibenzo[b,d]furan-2-yl)oxy]ethan-1-amine, ... (5 entities in total)
• 機能のキーワード: preq1 riboswitch, synthetic compound, complex, rna
• 由来する生物種: Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis
• タンパク質・核酸の鎖数: 1
• 化学式量合計: 10743.82

構造登録者

Numata, T.,Connelly, C.M.,Schneekloth, J.S.,Ferre-D'Amare, A.R. (登録日: 2018-07-10, 公開日: 2019-04-10, 最終更新日: 2023-10-11)

• 主引用文献: Connelly, C.M.,Numata, T.,Boer, R.E.,Moon, M.H.,Sinniah, R.S.,Barchi, J.J.,Ferre-D'Amare, A.R.,Schneekloth Jr., J.S.; Synthetic ligands for PreQ1riboswitches provide structural and mechanistic insights into targeting RNA tertiary structure.; Nat Commun, 10:1501-1501, 2019; PubMed: 30940810; DOI: 10.1038/s41467-019-09493-3

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å)