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6DIM

Crystal structure of Tdp1 catalytic domain in complex with Zenobia fragment ZT1982 from cocktail soak

6DIM の概要
エントリーDOI10.2210/pdb6dim/pdb
分子名称Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, 4-hydroxyquinoline-3-carboxylic acid, 1,2-ETHANEDIOL, ... (4 entities in total)
機能のキーワードfragment-based drug design, hydrolase-hydrolase inhibitor complex, hydrolase/hydrolase inhibitor
由来する生物種Homo sapiens (Human)
タンパク質・核酸の鎖数2
化学式量合計105003.41
構造登録者
Lountos, G.T.,Zhao, X.Z.,Kiselev, E.,Tropea, J.E.,Needle, D.,Burke Jr., T.R.,Pommier, Y.,Waugh, D.S. (登録日: 2018-05-23, 公開日: 2019-05-29, 最終更新日: 2024-03-13)
主引用文献Lountos, G.T.,Zhao, X.Z.,Kiselev, E.,Tropea, J.E.,Needle, D.,Pommier, Y.,Burke, T.R.,Waugh, D.S.
Identification of a ligand binding hot spot and structural motifs replicating aspects of tyrosyl-DNA phosphodiesterase I (TDP1) phosphoryl recognition by crystallographic fragment cocktail screening.
Nucleic Acids Res., 47:10134-10150, 2019
Cited by
PubMed: 31199869
DOI: 10.1093/nar/gkz515
主引用文献が同じPDBエントリー
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.81 Å)
構造検証レポート
Validation report summary of 6dim
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225158

件を2024-09-18に公開中

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