6D49

Cell Surface Receptor in Complex with Ligand at 1.80-A Resolution

6D49 の概要

関連するPDBエントリー6D48 6D4A
分子名称Myeloid cell surface antigen CD33, GLYCEROL, 2-aminoethyl 5-{[(4-cyclohexyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)acetyl]amino}-3,5,9-trideoxy-9-[(4-hydroxy-3,5-dimethylbenzene-1-carbonyl)amino]-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranonosyl-(2->6)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-beta-D-glucopyranoside, ... (4 entities in total)
機能のキーワードsialic acid binding, transmembrane, receptor, siglec, immune system
由来する生物種Homo sapiens (Human)
ポリマー鎖数2
分子量合計32071.41
構造登録者
Hermans, S.J.,Miles, L.A.,Parker, M.W. (登録日: 2018-04-17, 公開日: 2019-04-17)
主引用文献
Hermans, S.J.,Doughty, L.,Markulic, J.,Crespi, G.A.N.,Miles, L.A.,Parker, M.W.
Structural basis for the recognition of carbohydrates by the Alzheimer's disease risk factor CD33
To Be Published,
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.801 Å)
?

構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers 0.21160 0.9% 5.2%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
検証レポート(詳細版)をダウンロード

他の静止画像(非対称単位)

Molmil generated image of 6d49
回転なし
Molmil generated image of 6d49
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 6d49
y軸(上下方向)周りに90°回転

他の静止画像(生物学的単位)

Molmil generated image of 6d49
回転なし
Molmil generated image of 6d49
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 6d49
y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (6d49.pdb2.gz [27.53 KB])
生物学的単位の座標ファイル (6d49.pdb1.gz [27.66 KB])