5VMX

Kaiso (ZBTB33) zinc finger DNA binding domain in complex with a hemi CpG-methylated DNA resembling the specific Kaiso binding sequence (KBS)

5VMX の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5vmx/pdb
• 関連するPDBエントリー: 5VMU 5VMV 5VMW 5VMY 5VMZ
• 分子名称: Transcriptional regulator Kaiso, DNA (5'-D(*TP*GP*CP*TP*TP*CP*CP*(5CM)P*GP*(5CM)P*GP*AP*AP*TP*AP*AP*CP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*GP*TP*TP*AP*TP*TP*CP*GP*CP*GP*GP*GP*AP*AP*GP*CP*A)-3'), ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: dna methylation, zinc finger, transcriptional regulator, transcription-dna complex, transcription/dna
• 由来する生物種: Homo sapiens (Human); 詳細
• 細胞内の位置: Nucleus : Q86T24
• タンパク質・核酸の鎖数: 3
• 化学式量合計: 27510.66

構造登録者

Nikolova, E.N.,Stanfield, R.L.,Martinez-Yamout, M.A.,Dyson, H.J.,Wright, P.E. (登録日: 2017-04-28, 公開日: 2018-04-04, 最終更新日: 2023-10-04)

• 主引用文献: Nikolova, E.N.,Stanfield, R.L.,Dyson, H.J.,Wright, P.E.; CH···O Hydrogen Bonds Mediate Highly Specific Recognition of Methylated CpG Sites by the Zinc Finger Protein Kaiso.; Biochemistry, 57:2109-2120, 2018; PubMed: 29546986; DOI: 10.1021/acs.biochem.8b00065

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.05 Å)