5M2L

Structure of DNA tetrameric AGCGA-quadruplex adopted by 15-mer d(GCGAGGGAGCGAGGG), VK34, oligonucleotide found in regulatory region of the PLEKHG3 human gene

5M2L の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5m2l/pdb
• NMR情報: BMRB: 34054
• 分子名称: DNA (5'-D(*GP*CP*GP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*CP*GP*AP*GP*GP*G)-3') (1 entity in total)
• 機能のキーワード: agcga-quadruplex, tetramer, agcga-quadruplex family, gaga-quartet, g-g n1-carbonyl symmetric base pair, plekhg3 gene, dna
• 由来する生物種: Homo sapiens (Human)
• タンパク質・核酸の鎖数: 4
• 化学式量合計: 19060.34

構造登録者

Kocman, V.,Plavec, J. (登録日: 2016-10-13, 公開日: 2017-05-31, 最終更新日: 2019-10-30)

• 主引用文献: Kocman, V.,Plavec, J.; Tetrahelical structural family adopted by AGCGA-rich regulatory DNA regions.; Nat Commun, 8:15355-15355, 2017; PubMed: 28513602; DOI: 10.1038/ncomms15355

実験手法

SOLUTION NMR