5HD1

Crystal structure of antimicrobial peptide Pyrrhocoricin bound to the Thermus thermophilus 70S ribosome

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5HD1 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5hd1/pdb
• 関連するPDBエントリー: 5HAU 5HCP 5HCQ 5HCR
• 分子名称: 23S Ribosomal RNA, 50S ribosomal protein L14, 50S ribosomal protein L15, ... (59 entities in total)
• 機能のキーワード: pyrrhocoricin, antimicrobial peptide, antibiotic, 70s ribosome, inhibition of translation, peptidyl transferase inhibitors, 50s ribosomal subunit, peptide exit tunnel, ribosome-antibiotic complex, ribosome/antibiotic
• 由来する生物種: Escherichia coli; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 110
• 化学式量合計: 4470889.37

構造登録者

Gagnon, M.G.,Roy, R.N.,Lomakin, I.B.,Florin, T.,Mankin, A.S.,Steitz, T.A. (登録日: 2016-01-04, 公開日: 2016-04-06, 最終更新日: 2024-03-06)

• 主引用文献: Gagnon, M.G.,Roy, R.N.,Lomakin, I.B.,Florin, T.,Mankin, A.S.,Steitz, T.A.; Structures of proline-rich peptides bound to the ribosome reveal a common mechanism of protein synthesis inhibition.; Nucleic Acids Res., 44:2439-2450, 2016; PubMed: 26809677; DOI: 10.1093/nar/gkw018

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å)