5CLD

Alkylpurine DNA glycosylase AlkD bound to DNA containing an oxocarbenium-intermediate analog and a free 3-methyladenine nucleobase

5CLD の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5cld/pdb
• 関連するPDBエントリー: 5CL3 5CL4 5CL5 5CL6 5CL7 5CL8 5CL9 5CLA 5CLB 5CLC 5CLE
• 分子名称: AlkD, DNA (5'-D(*CP*CP*CP*GP*AP*(NRI)P*AP*GP*TP*CP*CP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*GP*GP*AP*CP*TP*TP*TP*CP*GP*GP*G)-3'), ... (5 entities in total)
• 機能のキーワード: dna glycosylase, heat-like repeat, protein-dna complex, hydrolase-dna complex, hydrolase/dna
• 由来する生物種: Bacillus cereus; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 3
• 化学式量合計: 35919.88

構造登録者

Mullins, E.A.,Eichman, B.F. (登録日: 2015-07-16, 公開日: 2015-10-28, 最終更新日: 2023-09-27)

• 主引用文献: Mullins, E.A.,Shi, R.,Parsons, Z.D.,Yuen, P.K.,David, S.S.,Igarashi, Y.,Eichman, B.F.; The DNA glycosylase AlkD uses a non-base-flipping mechanism to excise bulky lesions.; Nature, 527:254-258, 2015; PubMed: 26524531; DOI: 10.1038/nature15728

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.541 Å)