5C1O

Crystal structure of AMP-PNP complexed D-alanine-D-alanine ligase(DDL) from Yersinia pestis

5C1O の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5c1o/pdb
• 関連するPDBエントリー: 5C1P
• 分子名称: D-alanine--D-alanine ligase, PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER, SODIUM ION, ... (5 entities in total)
• 機能のキーワード: d-alanine-d-alanine ligase, ddl, drug target, bacterial cell wall synthesis, ligase
• 由来する生物種: Yersinia pestis
• 細胞内の位置: Cytoplasm : Q8ZIE7
• タンパク質・核酸の鎖数: 4
• 化学式量合計: 134956.11

構造登録者

Tran, H.T.,Kang, L.W.,Hong, M.K. (登録日: 2015-06-15, 公開日: 2016-03-02, 最終更新日: 2024-03-20)

• 主引用文献: Tran, H.T.,Hong, M.K.,Ngo, H.P.,Huynh, K.H.,Ahn, Y.J.,Wang, Z.,Kang, L.W.; Structure of D-alanine-D-alanine ligase from Yersinia pestis: nucleotide phosphate recognition by the serine loop.; Acta Crystallogr D Struct Biol, 72:12-21, 2016; PubMed: 26894530; DOI: 10.1107/S2059798315021671

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å)