4YLH

Crystal structure of DpgC with bound substrate analog and Xe on oxygen diffusion pathway

4YLH の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb4ylh/pdb
• 関連するPDBエントリー: 2NP9 2PG8
• 分子名称: DpgC, XENON, [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-4-HYDROXY-3-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL (3R)-4-({3-[(2-{[(3,5-DIHYDROXYPHENYL)ACETYL]AMINO}ETHYL)AMINO]-3-OXOPROPYL}AMINO)-3-HYDROXY-2,2-DIMETHYL-4-OXOBUTYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE, ... (4 entities in total)
• 機能のキーワード: dioxygenase, xe complex, hydrolase
• 由来する生物種: Streptomyces toyocaensis
• タンパク質・核酸の鎖数: 12
• 化学式量合計: 592814.04

構造登録者

Li, K.,Di Russo, N.V.,Condurso, H.L.,Roitberg, A.E.,Bruner, S.D. (登録日: 2015-03-05, 公開日: 2015-08-05, 最終更新日: 2023-09-27)

• 主引用文献: Di Russo, N.V.,Condurso, H.L.,Li, K.,Bruner, S.D.,Roitberg, A.E.; Oxygen diffusion pathways in a cofactor-independent dioxygenase.; Chem Sci, 6:6341-6348, 2015; PubMed: 26508997; DOI: 10.1039/C5SC01638J

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.58 Å)