4RRF

Editing domain of threonyl-tRNA synthetase from Methanococcus jannaschii with L-Ser3AA

4RRF の概要

関連するPDBエントリー4RR6 4RR7 4RR8 4RR9 4RRA 4RRB 4RRC 4RRD 4RRG 4RRH 4RRI 4RRJ 4RRK 4RRL 4RRM 4RRQ 4RRR
分子名称Threonine--tRNA ligase, SERINE-3'-AMINOADENOSINE, CHLORIDE ION, ... (5 entities in total)
機能のキーワードdtd-like fold, proofreading, ligase
由来する生物種Methanocaldococcus jannaschii
細胞内の位置Cytoplasm  Q58597
ポリマー鎖数6
分子量合計97911.88
構造登録者
Ahmad, S.,Yerabham, A.S.K.,Kamarthapu, V.,Sankaranarayanan, R. (登録日: 2014-11-06, 公開日: 2015-07-15, 最終更新日: 2017-11-22)
主引用文献
Ahmad, S.,Muthukumar, S.,Kuncha, S.K.,Routh, S.B.,Yerabham, A.S.,Hussain, T.,Kamarthapu, V.,Kruparani, S.P.,Sankaranarayanan, R.
Specificity and catalysis hardwired at the RNA-protein interface in a translational proofreading enzyme.
Nat Commun, 6:7552-7552, 2015
PubMed: 26113036 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1038/ncomms8552
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.7 Å)
?

構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.239602.8%1.0%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
検証レポート(詳細版)をダウンロード

他の静止画像(非対称単位)

Molmil generated image of 4rrf
回転なし
Molmil generated image of 4rrf
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 4rrf
y軸(上下方向)周りに90°回転

他の静止画像(生物学的単位)

Molmil generated image of 4rrf
回転なし
Molmil generated image of 4rrf
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 4rrf
y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (4rrf.pdb2.gz [50.05 KB])
生物学的単位の座標ファイル (4rrf.pdb3.gz [51.13 KB])
生物学的単位の座標ファイル (4rrf.pdb1.gz [50.76 KB])