4RR7

N-terminal editing domain of threonyl-tRNA synthetase from Aeropyrum pernix with L-Ser3AA (snapshot 2)

4RR7 の概要

関連するPDBエントリー4RR6 4RR8 4RR9 4RRA 4RRB 4RRC 4RRD 4RRF 4RRG 4RRH 4RRI 4RRJ 4RRK 4RRL 4RRM 4RRQ 4RRR
分子名称Probable threonine--tRNA ligase 2, SERINE-3'-AMINOADENOSINE, MAGNESIUM ION, ... (4 entities in total)
機能のキーワードdtd-like fold, proofreading, ligase
由来する生物種Aeropyrum pernix K1
細胞内の位置Cytoplasm  Q9YFY3
ポリマー鎖数1
分子量合計15513.05
構造登録者
Ahmad, S.,Muthukumar, S.,Yerabham, A.S.K.,Kamarthapu, V.,Sankaranarayanan, R. (登録日: 2014-11-06, 公開日: 2015-07-15, 最終更新日: 2017-11-22)
主引用文献
Ahmad, S.,Muthukumar, S.,Kuncha, S.K.,Routh, S.B.,Yerabham, A.S.,Hussain, T.,Kamarthapu, V.,Kruparani, S.P.,Sankaranarayanan, R.
Specificity and catalysis hardwired at the RNA-protein interface in a translational proofreading enzyme.
Nat Commun, 6:7552-7552, 2015
PubMed: 26113036 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1038/ncomms8552
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.86 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.23730.7%3.5%0.7%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (4rr7.pdb1.gz [51.31 KB])