4JCQ

ClpP1 from Listeria monocytogenes

4JCQ の概要

関連するPDBエントリー3V5E 2FZS 1TYF 4JCR
分子名称ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit (2 entities in total)
機能のキーワードpathogenic bacteria, virulence factor, regulation, clp protease family, inactive catalytic triad, hydrolase
由来する生物種Listeria monocytogenes
細胞内の位置Cytoplasm (By similarity) Q8Y7Y1
ポリマー鎖数28
分子量合計635645.22
構造登録者
Zeiler, E.,List, A.,Alte, F.,Gersch, M.,Wachtel, R.,Groll, M.,Sieber, S. (登録日: 2013-02-22, 公開日: 2013-06-12, 最終更新日: 2013-07-24)
主引用文献
Zeiler, E.,List, A.,Alte, F.,Gersch, M.,Wachtel, R.,Poreba, M.,Drag, M.,Groll, M.,Sieber, S.A.
Structural and functional insights into caseinolytic proteases reveal an unprecedented regulation principle of their catalytic triad.
Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110:11302-11307, 2013
PubMed: 23798410 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1073/pnas.1219125110
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実験手法
X-RAY DIFFRACTION (2 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.213304.1%7.5%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

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回転なし
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x軸(左右方向)周りに90°回転
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y軸(上下方向)周りに90°回転

他の静止画像(生物学的単位)

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x軸(左右方向)周りに90°回転
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y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (4jcq.pdb5.gz [837.73 KB])
生物学的単位の座標ファイル (4jcq.pdb6.gz [832.65 KB])
生物学的単位の座標ファイル (4jcq.pdb1.gz [422.9 KB])
生物学的単位の座標ファイル (4jcq.pdb2.gz [423.18 KB])
生物学的単位の座標ファイル (4jcq.pdb3.gz [423.98 KB])
生物学的単位の座標ファイル (4jcq.pdb4.gz [419.31 KB])