4DA3

Crystal structure of an intramolecular human telomeric DNA G-quadruplex 21-mer bound by the naphthalene diimide compound MM41.

4DA3 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb4da3/pdb
• 関連するPDBエントリー: 3SC8 3T5E 3UYH 4DAQ
• 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*GP*TP*TP*AP*GP*GP*G)-3'), POTASSIUM ION, 4,9-bis{[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl]amino}-2,7-bis[3-(morpholin-4-yl)propyl]benzo[lmn][3,8]phenanthroline-1,3,6,8(2H,7H)-tetrone, ... (4 entities in total)
• 機能のキーワード: intramolecular, ligand-complex, g-quadruplex, telomere, dna
• 由来する生物種: Synthetic DNA
• タンパク質・核酸の鎖数: 1
• 化学式量合計: 7618.64

構造登録者

Collie, G.W.,Neidle, S. (登録日: 2012-01-12, 公開日: 2013-01-30, 最終更新日: 2023-09-13)

• 主引用文献: Micco, M.,Collie, G.W.,Dale, A.G.,Ohnmacht, S.A.,Pazitna, I.,Gunaratnam, M.,Reszka, A.P.,Neidle, S.; Structure-based design and evaluation of naphthalene diimide g-quadruplex ligands as telomere targeting agents in pancreatic cancer cells.; J.Med.Chem., 56:2959-2974, 2013; PubMed: 23514618; DOI: 10.1021/jm301899y

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å)