3U05

Crystal structure of DB1804-D(CGCGAATTCGCG)2 complex

3U05 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb3u05/pdb
• 関連するPDBエントリー: 3U08
• 分子名称: 5'-D(*CP*GP*CP*GP*AP*AP*TP*TP*CP*GP*CP*G)-3', MAGNESIUM ION, 6-(1,4,5,6-tetrahydropyrimidin-2-yl)-2-[4'-(1,4,5,6-tetrahydropyrimidin-2-yl)biphenyl-4-yl]-1H-indole, ... (4 entities in total)
• 機能のキーワード: a2t2, dickerson and drew dodecamer, double helix, dna minor groove-ligand complex, dna minor groove binder, db1804, mg2+, dna
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 7784.64

構造登録者

Wei, D.G.,Neidle, S. (登録日: 2011-09-28, 公開日: 2012-09-12, 最終更新日: 2024-02-28)

• 主引用文献: Wei, D.,Wilson, W.D.,Neidle, S.; Small-molecule binding to the DNA minor groove is mediated by a conserved water cluster.; J.Am.Chem.Soc., 135:1369-1377, 2013; PubMed: 23276263; DOI: 10.1021/ja308952y

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.27 Å)