3Q4D

Crystal structure of dipeptide epimerase from Cytophaga hutchinsonii complexed with Mg and dipeptide D-Ala-L-Ala

3Q4D の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb3q4d/pdb
• 関連するPDBエントリー: 3Q45
• 分子名称: Mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family; possible chloromuconate cycloisomerase, MAGNESIUM ION, D-ALANINE, ... (5 entities in total)
• 機能のキーワード: (beta/alpha)8-barrel, isomerase
• 由来する生物種: Cytophaga hutchinsonii
• タンパク質・核酸の鎖数: 9
• 化学式量合計: 365004.16

構造登録者

Lukk, T.,Gerlt, J.A.,Nair, S.K. (登録日: 2010-12-23, 公開日: 2011-02-16, 最終更新日: 2023-09-13)

• 主引用文献: Lukk, T.,Sakai, A.,Kalyanaraman, C.,Brown, S.D.,Imker, H.J.,Song, L.,Fedorov, A.A.,Fedorov, E.V.,Toro, R.,Hillerich, B.,Seidel, R.,Patskovsky, Y.,Vetting, M.W.,Nair, S.K.,Babbitt, P.C.,Almo, S.C.,Gerlt, J.A.,Jacobson, M.P.; Homology models guide discovery of diverse enzyme specificities among dipeptide epimerases in the enolase superfamily.; Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 109:4122-4127, 2012; PubMed: 22392983; DOI: 10.1073/pnas.1112081109

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (3 Å)