3KVV

Trapping of an oxocarbenium ion intermediate in UP crystals

3KVV の概要

関連するPDBエントリー3KU4 3KUK 3KVR 3KVY
分子名称Uridine phosphorylase, 5-FLUOROURACIL, SULFATE ION, ... (5 entities in total)
機能のキーワードoxocarbenium ion, glycal, pyrimidine salvage, uridine phosphorylase, cytoplasm, glycosyltransferase, transferase
由来する生物種Escherichia coli
細胞内の位置Cytoplasm P12758
ポリマー鎖数6
分子量合計165283.86
構造登録者
Paul, D.,O'Leary, S.,Rajashankar, K.,Bu, W.,Toms, A.,Settembre, E.,Sanders, J.,Begley, T.P.,Ealick, S.E. (登録日: 2009-11-30, 公開日: 2010-04-28, 最終更新日: 2011-07-13)
主引用文献
Paul, D.,O'Leary, S.E.,Rajashankar, K.,Bu, W.,Toms, A.,Settembre, E.C.,Sanders, J.M.,Begley, T.P.,Ealick, S.E.
Glycal formation in crystals of uridine phosphorylase.
Biochemistry, 49:3499-3509, 2010
PubMed: 20364833 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1021/bi902073b
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実験手法
X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.20380.4%1.8%0.8%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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