3CWH

D-xylose Isomerase in complex with linear product, per-deuterated xylulose

3CWH の概要

関連するPDBエントリー2GVE
分子名称Xylose isomerase, D-XYLULOSE, MAGNESIUM ION, ... (5 entities in total)
機能のキーワードenzyme-product complex, carbohydrate metabolism, isomerase, magnesium, metal-binding, pentose shunt, xylose metabolism
由来する生物種Streptomyces rubiginosus
細胞内の位置Cytoplasm P24300
ポリマー鎖数1
分子量合計43499.04
構造登録者
Kovalevsky, A.Y.,Langan, P.,Glusker, J.P. (登録日: 2008-04-21, 公開日: 2008-08-05, 最終更新日: 2011-07-13)
主引用文献
Kovalevsky, A.Y.,Katz, A.K.,Carrell, H.L.,Hanson, L.,Mustyakimov, M.,Fisher, S.Z.,Coates, L.,Schoenborn, B.P.,Bunick, G.J.,Glusker, J.P.,Langan, P.
Hydrogen location in stages of an enzyme-catalyzed reaction: time-of-flight neutron structure of D-xylose isomerase with bound D-xylulose
Biochemistry, 47:7595-7597, 2008
PubMed: 18578508 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1021/bi8005434
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実験手法
NEUTRON DIFFRACTION (2.2 Å)
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構造検証レポート

ClashscoreRamachandran outliersSidechain outliers51.0%3.0%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (3cwh.pdb1.gz [473.83 KB])