2O80

Duplex DNA containing an abasic site with an opposite dC (alpha anomer) in 5'-G_AC-3' (10 structure ensemble and averaged structure)

2O80 の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb2o80/pdb
• 関連するPDBエントリー: 2HSL 2HSR 2O7W 2O7X 2O7Y 2O7Z 2O82
• 分子名称: 5'-D(*CP*CP*AP*AP*AP*GP*(ORP)P*AP*CP*CP*GP*GP*G)-3', 5'-D(*CP*CP*CP*GP*GP*TP*CP*CP*TP*TP*TP*GP*G)-3' (2 entities in total)
• 機能のキーワード: dna damage, ape1, abasic, amber, molecular dynamics, dna
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 7812.06

構造登録者

Chen, J.,Dupradeau, F.Y.,Case, D.A.,Turner, C.J.,Stubbe, J. (登録日: 2006-12-11, 公開日: 2007-11-27, 最終更新日: 2023-11-29)

• 主引用文献: Chen, J.,Dupradeau, F.Y.,Case, D.A.,Turner, C.J.,Stubbe, J.; DNA oligonucleotides with A, T, G or C opposite an abasic site: structure and dynamics.; Nucleic Acids Res., 36:253-262, 2008; PubMed: 18025040; DOI: 10.1093/nar/gkm622

実験手法

SOLUTION NMR