2HSK

NMR Structure of 13mer Duplex DNA containing an abasic site (Y) in 5'-CCAAAGYACCGGG-3' (10 structures, alpha anomer)

2HSK の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb2hsk/pdb
• 関連するPDBエントリー: 2HOU 2HPX 2HSL 2HSR 2HSS
• 分子名称: 5'-D(*CP*CP*AP*AP*AP*GP*(D1P)P*AP*CP*CP*GP*GP*G)-3', 5'-D(*CP*CP*CP*GP*GP*TP*AP*CP*TP*TP*TP*GP*G)-3' (2 entities in total)
• 機能のキーワード: abasic site, dna lesion, base excision repair, ape1, dna
• 由来する生物種: synthetic construct; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 7836.09

構造登録者

Chen, J.,Dupradeau, F.Y.,Case, D.A.,Turner, C.J.,Stubbe, J. (登録日: 2006-07-21, 公開日: 2007-05-29, 最終更新日: 2024-05-01)

• 主引用文献: Chen, J.,Dupradeau, F.Y.,Case, D.A.,Turner, C.J.,Stubbe, J.; Nuclear magnetic resonance structural studies and molecular modeling of duplex DNA containing normal and 4'-oxidized abasic sites.; Biochemistry, 46:3096-3107, 2007; PubMed: 17323932; DOI: 10.1021/bi6024269

実験手法

SOLUTION NMR