2DQT

High resolution crystal structure of the complex of the hydrolytic antibody Fab 6D9 and a transition-state analog

「1HYX」から置き換えられました

2DQT の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb2dqt/pdb
• 関連するPDBエントリー: 2DQU
• 分子名称: IMMUNOGLOBULIN 6D9, [1-(3-DIMETHYLAMINO-PROPYL)-3-ETHYL-UREIDO]-[4-(2,2,2-TRIFLUORO-ACETYLAMINO)-BENZYL]PHOSPHINIC ACID-2-(2,2-DIHYDRO-ACETYLAMINO)-3-HYDROXY-1-(4-NITROPHENYL)-PROPYL ESTER, ... (4 entities in total)
• 機能のキーワード: catalytic antibody, ester hydrolysis, esterolytic, fab, immunoglobulin, immune system
• 由来する生物種: Mus musculus (house mouse); 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 2
• 化学式量合計: 48979.38

構造登録者

Kristensen, O.,Vassylyev, D.G.,Tanaka, F.,Ito, N.,Morikawa, K.,Fujii, I. (登録日: 2006-05-30, 公開日: 2006-06-20, 最終更新日: 2023-10-25)

• 主引用文献: Oda, M.,Ito, N.,Tsumuraya, T.,Suzuki, K.,Sakakura, M.,Fujii, I.; Thermodynamic and structural basis for transition-state stabilization in antibody-catalyzed hydrolysis; J.Mol.Biol., 369:198-209, 2007; PubMed: 17428500; DOI: 10.1016/j.jmb.2007.03.023

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å)