2BE0
Complex Between Paromomycin Derivative JS5-39 and the 16S-Rrna A-Site.
2BE0 の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb2be0/pdb |
関連するPDBエントリー | 1J7T 2BEE 2ESI 2ESJ |
分子名称 | 5'-R(*CP*GP*CP*GP*UP*CP*AP*CP*AP*CP*CP*GP*GP*UP*GP*AP*AP*GP*UP*CP*GP*C)-3', (2S,3S,4R,5R,6R)-5-AMINO-2-(AMINOMETHYL)-6-((2R,3R,4R,5S)-5-((1R,2R,3S,5R,6S)-3,5-DIAMINO-2-((2S,3R,4R,5S,6R)-3-AMINO-4 ,5-DIHYDROXY-6-(HYDROXYMETHYL)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-2-YLOXY)-6-HYDROXYCYCLOHEXYLOXY)-2-(HYDROXYMETHYL)-4-(2-((R)-PIPERIDI N-3-YLMETHYLAMINO)ETHOXY)-TETRAHYDROFURAN-3-YLOXY)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-3,4-DIOL (3 entities in total) |
機能のキーワード | rna-aminoglycoside interactions, a site, uou pairs, aa bulges, rna-antibiotic complex, rna/antibiotic |
由来する生物種 | Streptomyces rimosus subsp. paromomycinus |
タンパク質・核酸の鎖数 | 2 |
化学式量合計 | 15608.23 |
構造登録者 | |
主引用文献 | Francois, B.,Szychowski, J.,Adhikari, S.S.,Pachamuthu, K.,Swayze, E.E.,Griffey, R.H.,Migawa, M.T.,Westhof, E.,Hanessian, S. Antibacterial aminoglycosides with a modified mode of binding to the ribosomal-RNA decoding site ANGEW.CHEM.INT.ED.ENGL., 43:6735-6738, 2004 Cited by PubMed: 15593140DOI: 10.1002/anie.200462092 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.63 Å) |
構造検証レポート
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