1YCB

DISTAL POCKET POLARITY IN LIGAND BINDING TO MYOGLOBIN: DEOXY AND CARBONMONOXY FORMS OF A THREONINE68 (E11) MUTANT INVESTIGATED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY AND INFRARED SPECTROSCOPY

1YCB の概要

分子名称MYOGLOBIN, PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE (3 entities in total)
機能のキーワードoxygen storage
由来する生物種Sus scrofa (pig)
ポリマー鎖数2
分子量合計35203.81
構造登録者
Cameron, A.D.,Smerdon, S.J.,Wilkinson, A.J.,Habash, J.,Helliwell, J.R. (登録日: 1993-08-10, 公開日: 1994-01-31, 最終更新日: 2011-07-13)
主引用文献
Cameron, A.D.,Smerdon, S.J.,Wilkinson, A.J.,Habash, J.,Helliwell, J.R.,Li, T.,Olson, J.S.
Distal pocket polarity in ligand binding to myoglobin: deoxy and carbonmonoxy forms of a threonine68(E11) mutant investigated by X-ray crystallography and infrared spectroscopy.
Biochemistry, 32:13061-13070, 1993
PubMed: 8241160 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1021/bi00211a016
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実験手法
X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å)
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構造検証レポート

ClashscoreRamachandran outliersSidechain outliers231.3%8.1%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

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他の静止画像(生物学的単位)

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y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (1ycb.pdb1.gz [28.05 KB])
生物学的単位の座標ファイル (1ycb.pdb2.gz [28.41 KB])