1PZU

An asymmetric NFAT1-RHR homodimer on a pseudo-palindromic, Kappa-B site

1PZU の概要

関連するPDBエントリー1A02
分子名称5'-D(*TP*TP*GP*AP*GP*GP*AP*AP*TP*TP*TP*CP*CP*A)-3', 5'-D(*AP*AP*TP*GP*GP*AP*AP*AP*TP*TP*CP*CP*TP*C)-3', Nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic 2 (3 entities in total)
機能のキーワードtranscription factor, nfat1-rhr homodimer, protein-dna complex, human il8 promoter, transcription-dna complex, transcription/dna
由来する生物種Homo sapiens (human)
細胞内の位置Cytoplasm Q13469
ポリマー鎖数12
分子量合計231301.24
構造登録者
Jin, L.,Sliz, P.,Chen, L.,Macian, F.,Rao, A.,Hogan, P.G.,Harrison, S.C. (登録日: 2003-07-14, 公開日: 2003-09-09, 最終更新日: 2011-07-13)
主引用文献
Jin, L.,Sliz, P.,Chen, L.,Macian, F.,Rao, A.,Hogan, P.G.,Harrison, S.C.
An asymmetric NFAT1 dimer on a pseudo-palindromic KB-like DNA site
Nat.Struct.Biol., 10:807-811, 2003
PubMed: 12949491 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1038/nsb975
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実験手法
X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.301384.9%5.8%5.9%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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他の静止画像(非対称単位)

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回転なし
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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (1pzu.pdb3.gz [103.66 KB])
生物学的単位の座標ファイル (1pzu.pdb1.gz [103.72 KB])
生物学的単位の座標ファイル (1pzu.pdb2.gz [103.82 KB])