1NU9

Staphylocoagulase-Prethrombin-2 complex

1NU9 の概要

関連するPDBエントリー1nu7
関連するBIRD辞書のPRD_IDPRD_000377
分子名称Thrombin light and heavy chains, Staphylocoagulase, N-(sulfanylacetyl)-D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide, ... (6 entities in total)
機能のキーワードthrombin non-proteolytic activator, endocarditis, hydrolase-hydrolase inhibitor complex, protein binding, hydrolase/hydrolase inhibitor
由来する生物種Staphylococcus aureus
詳細
細胞内の位置Secreted, extracellular space P00734
ポリマー鎖数4
分子量合計135632.22
構造登録者
Friedrich, R.,Bode, W.,Fuentes-Prior, P.,Panizzi, P.,Bock, P.E. (登録日: 2003-01-31, 公開日: 2003-10-07, 最終更新日: 2012-12-12)
主引用文献
Friedrich, R.,Panizzi, P.,Fuentes-Prior, P.,Richter, K.,Verhamme, I.,Anderson, P.J.,Kawabata, S.,Huber, R.,Bode, W.,Bock, P.E.
Staphylocoagulase is a prototype for the mechanism of cofactor-induced zymogen activation
NATURE, 425:535-539, 2003
PubMed: 14523451 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1038/nature01962
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å)
NMR情報
?

構造検証レポート

ClashscoreRamachandran outliersSidechain outliers120.4%4.8%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
検証レポート(詳細版)をダウンロード

他の静止画像(非対称単位)

Molmil generated image of 1nu9
回転なし
Molmil generated image of 1nu9
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 1nu9
y軸(上下方向)周りに90°回転

他の静止画像(生物学的単位)

Molmil generated image of 1nu9
回転なし
Molmil generated image of 1nu9
x軸(左右方向)周りに90°回転
Molmil generated image of 1nu9
y軸(上下方向)周りに90°回転
(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (1nu9.pdb1.gz [105.93 KB])
生物学的単位の座標ファイル (1nu9.pdb2.gz [105.47 KB])