1MB2

Crystal Structure of Tryptophanyl-tRNA Synthetase Complexed with Tryptophan in an Open Conformation

1MB2 の概要

関連するPDBエントリー1D2R 1I6M 1M83 1MAU 1MAW
分子名称TRYPTOPHAN-TRNA LIGASE, TRYPTOPHAN (2 entities in total)
機能のキーワードaminoacyl-trna synthetase, rossmann fold, amino acid binding site, ligase
由来する生物種Geobacillus stearothermophilus
細胞内の位置Cytoplasm  P00953
ポリマー鎖数6
分子量合計224579.38
構造登録者
Retailleau, P.,Huang, X.,Yin, Y.,Hu, M.,Weinreb, V.,Vachette, P.,Vonrhein, C.,Bricogne, G.,Roversi, P.,Ilyin, V.,Carter Jr., C.W. (登録日: 2002-08-02, 公開日: 2003-01-07, 最終更新日: 2018-04-04)
主引用文献
Retailleau, P.,Huang, X.,Yin, Y.,Hu, M.,Weinreb, V.,Vachette, P.,Vonrhein, C.,Bricogne, G.,Roversi, P.,Ilyin, V.,Carter, C.W.
Interconversion of ATP binding and conformational free energies by tryptophanyl-tRNA synthetase: structures of ATP bound to open and closed, pre-transition-state conformations.
J.Mol.Biol., 325:39-63, 2003
PubMed: 12473451 (主引用文献が同じPDBエントリー)
DOI: 10.1016/S0022-2836(02)01156-7
MImport into Mendeley
実験手法
X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å)
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構造検証レポート

RfreeClashscoreRamachandran outliersSidechain outliersRSRZ outliers0.225182.5%8.8%5.1%MetricValuePercentile RanksWorseBetterPercentile relative to all X-ray structuresPercentile relative to X-ray structures of similar resolution
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(*)表面構造(coarse surface)で表現されている場合、非対称単位は、赤色のリボンモデルで表示されています。
生物学的単位の座標ファイル (1mb2.pdb1.gz [106.79 KB])
生物学的単位の座標ファイル (1mb2.pdb2.gz [106.05 KB])
生物学的単位の座標ファイル (1mb2.pdb3.gz [106.67 KB])