6AAZ
Crystal structure of Methanosarcina mazei PylRS(Y306A/Y384F) complexed with pNO2ZLys
エンティティ
| Entity ID | 鎖名 | 説明 | 種類 | 鎖長 | 化学式量 | 分子数 | データベース名(アクセス番号) | 由来する生物種 | エンティティの一般名 |
| 1 | A | Pyrrolysine--tRNA ligase | polymer | 274 | 31347.0 | 1 | UniProt (A0A0F8JXW8) Pfam (PF01409) UniProt (by SIFTS) (Q8PWY1) In PDB | Methanosarcina mazei JCM 9314 | Pyrrolysyl-tRNA synthetase,PylRS |
| 2 | A | MAGNESIUM ION | non-polymer | 24.3 | 3 | Chemie (MG) | |||
| 3 | A | ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE | non-polymer | 507.2 | 1 | Chemie (ATP) | |||
| 4 | A | N6-{[(4-nitrophenyl)methoxy]carbonyl}-L-lysine | non-polymer | 325.3 | 1 | Chemie (9UC) | |||
| 5 | A | CITRIC ACID | non-polymer | 192.1 | 1 | Chemie (CIT) | |||
| 6 | A | POTASSIUM ION | non-polymer | 39.1 | 3 | Chemie (K) | |||
| 7 | water | water | 18.0 | 277 | Chemie (HOH) |
配列変更
A: 185 - 454 (UniProt: A0A0F8JXW8)
| PDB | 外部データベース | 詳細 |
|---|---|---|
| Gly 181 | - | expression tag |
| Ser 182 | - | expression tag |
| His 183 | - | expression tag |
| Met 184 | - | expression tag |
| Ala 306 | Tyr 306 | engineered mutation |
| Phe 384 | Tyr 384 | engineered mutation |
| Gly 444 | Glu 444 | see sequence details |
配列ビューア
非対称単位の内容
| タンパク質・ 核酸鎖 | 鎖の数 | 1 |
| 化学式量合計 | 31347.0 | |
| タンパク質・ 核酸・ 糖鎖以外* | 分子数 | 9 |
| 化学式量合計 | 1214.8 | |
| 全て* | 化学式量合計 | 32561.8 |
