PDB: 2564 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

---

4I8H	Bovine trypsin at 0.75 resolution 分子名称: BENZAMIDINE, CALCIUM ION, Cationic trypsin, ... 著者 Dauter, Z, Liebschner, D, Dauter, M, Brzuszkiewicz, A. 登録日 2012-12-03 公開日 2012-12-19 最終更新日 2013-09-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.75 Å) 主引用文献 On the reproducibility of protein crystal structures: five atomic resolution structures of trypsin. Acta Crystallogr.,Sect.D, 69, 2013
5KWM	S. erythraea trypsin long construct apoenzyme 分子名称: Trypsin 著者 Blankenship, E, Lodowski, D.T. 登録日 2016-07-18 公開日 2017-10-18 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.777 Å) 主引用文献 S. erythraea trypsin long construct To be Published
5MN1	Cationic trypsin in complex with 2-aminopyridine (deuterated sample at 100 K) 分子名称: 2-AMINOPYRIDINE, CALCIUM ION, Cationic trypsin, ... 著者 Schiebel, J, Heine, A, Klebe, G. 登録日 2016-12-12 公開日 2017-05-24 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.79 Å) 主引用文献 Charges Shift Protonation: Neutron Diffraction Reveals that Aniline and 2-Aminopyridine Become Protonated Upon Binding to Trypsin. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 56, 2017
5MNK	Cationic trypsin in complex with benzylamine (deuterated sample at 100 K) 分子名称: BENZYLAMINE, CALCIUM ION, Cationic trypsin, ... 著者 Schiebel, J, Heine, A, Klebe, G. 登録日 2016-12-13 公開日 2018-01-17 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.799 Å) 主引用文献 Cationic trypsin in complex with benzylamine (deuterated sample at 100 K) to be published
3MFJ	Bovine trypsin at 0.8 A resolution, restrained refinement 分子名称: BENZAMIDINE, CALCIUM ION, Cationic trypsin, ... 著者 Brzuszkiewicz, A, Dauter, M, Dauter, Z. 登録日 2010-04-02 公開日 2010-04-21 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.8 Å) 主引用文献 Bovine trypsin at 0.8 A and role of restraints at ultra-high resolution To be Published
3MI4	Bovine trypsin at 0.8 A resolution, non-restrained refinement 分子名称: BENZAMIDINE, CALCIUM ION, Cationic trypsin, ... 著者 Brzuszkiewicz, A, Dauter, M, Dauter, Z. 登録日 2010-04-09 公開日 2010-04-28 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.8 Å) 主引用文献 Bovine trypsin at 0.8 A and role of restraints at ultra-high resolution To be Published
1PQ7	Trypsin at 0.8 A, pH5 / borax 分子名称: ARGININE, SULFATE ION, Trypsin 著者 Schmidt, A, Jelsch, C, Rypniewski, W, Lamzin, V.S. 登録日 2003-06-18 公開日 2003-11-11 最終更新日 2017-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.8 Å) 主引用文献 Trypsin Revisited: CRYSTALLOGRAPHY AT (SUB) ATOMIC RESOLUTION AND QUANTUM CHEMISTRY REVEALING DETAILS OF CATALYSIS. J.Biol.Chem., 278, 2003
4I8G	Bovine trypsin at 0.8 resolution 分子名称: BENZAMIDINE, CALCIUM ION, Cationic trypsin, ... 著者 Dauter, Z, Liebschner, D, Dauter, M, Brzuszkiewicz, A. 登録日 2012-12-03 公開日 2012-12-19 最終更新日 2013-09-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.8 Å) 主引用文献 On the reproducibility of protein crystal structures: five atomic resolution structures of trypsin. Acta Crystallogr.,Sect.D, 69, 2013
4M7G	Streptomyces Erythraeus Trypsin 分子名称: Trypsin-like protease 著者 Blankenship, E, Vukoti, K, Miyagi, M, Lodowski, D.T. 登録日 2013-08-12 公開日 2014-03-12 最終更新日 2023-09-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.81 Å) 主引用文献 Conformational flexibility in the catalytic triad revealed by the high-resolution crystal structure of Streptomyces erythraeus trypsin in an unliganded state. Acta Crystallogr.,Sect.D, 70, 2014
1FN8	FUSARIUM OXYSPORUM TRYPSIN AT ATOMIC RESOLUTION 分子名称: GLY-ALA-ARG, GLYCEROL, SULFATE ION, ... 著者 Rypniewski, W.R, Oestergaard, P, Noerregaard-Madsen, M, Dauter, M, Wilson, K.S. 登録日 2000-08-21 公開日 2001-02-07 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.81 Å) 主引用文献 Fusarium oxysporum trypsin at atomic resolution at 100 and 283 K: a study of ligand binding. Acta Crystallogr.,Sect.D, 57, 2001
1FY5	Fusarium oxysporum trypsin at atomic resolution 分子名称: GLY-ALA-LYS, GLYCEROL, SULFATE ION, ... 著者 Rypniewski, W.R, Oestergaard, P, Noerregaard-Madsen, M, Dauter, M, Wilson, K.S. 登録日 2000-09-28 公開日 2001-02-07 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.81 Å) 主引用文献 Fusarium oxysporum trypsin at atomic resolution at 100 and 283 K: a study of ligand binding. Acta Crystallogr.,Sect.D, 57, 2001
1GDN	FUSARIUM OXYSPORUM TRYPSIN AT ATOMIC RESOLUTION 分子名称: GLY-ALA-LYS, GLYCEROL, SULFATE ION, ... 著者 Rypniewski, W.R, Oestergaard, P, Noerregaard-Madsen, M, Dauter, M, Wilson, K.S. 登録日 2000-09-28 公開日 2001-02-07 最終更新日 2023-12-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.81 Å) 主引用文献 Fusarium oxysporum trypsin at atomic resolution at 100 and 283 K: a study of ligand binding. Acta Crystallogr.,Sect.D, 57, 2001
1FY4	FUSARIUM OXYSPORUM TRYPSIN AT ATOMIC RESOLUTION 分子名称: GLY-ALA-ARG, GLYCEROL, SULFATE ION, ... 著者 Rypniewski, W.R, Oestergaard, P, Noerregaard-Madsen, M, Dauter, M, Wilson, K.S. 登録日 2000-09-28 公開日 2001-02-07 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.81 Å) 主引用文献 Fusarium oxysporum trypsin at atomic resolution at 100 and 283 K: a study of ligand binding. Acta Crystallogr.,Sect.D, 57, 2001
2H5C	0.82A resolution crystal structure of alpha-lytic protease at pH 5 分子名称: ALPHA-LYTIC PROTEASE, GLYCEROL, SULFATE ION 著者 Fuhrmann, C.N, Daugherty, M.D, Agard, D.A. 登録日 2006-05-25 公開日 2006-09-26 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.82 Å) 主引用文献 Subangstrom crystallography reveals that short ionic hydrogen bonds, and not a His-Asp low-barrier hydrogen bond, stabilize the transition state in serine protease catalysis J.Am.Chem.Soc., 128, 2006
1SSX	0.83A resolution crystal structure of alpha-lytic protease at pH 8 分子名称: Alpha-lytic protease, GLYCEROL, SULFATE ION 著者 Fuhrmann, C.N, Agard, D.A. 登録日 2004-03-24 公開日 2004-05-04 最終更新日 2023-08-23 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.83 Å) 主引用文献 The 0.83A Resolution Crystal Structure of alpha-Lytic Protease Reveals the Detailed Structure of the Active Site and Identifies a Source of Conformational Strain. J.Mol.Biol., 338, 2004
1XVO	Trypsin from Fusarium oxysporum at pH 6 分子名称: SULFATE ION, trypsin 著者 Schmidt, A, Lamzin, V.S. 登録日 2004-10-28 公開日 2005-07-26 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.84 Å) 主引用文献 Extraction of functional motion in trypsin crystal structures. Acta Crystallogr.,Sect.D, 61, 2005
4I8K	Bovine trypsin at 0.85 resolution 分子名称: BENZAMIDINE, CALCIUM ION, Cationic trypsin, ... 著者 Dauter, Z, Liebschner, D, Dauter, M, Brzuszkiewicz, A. 登録日 2012-12-03 公開日 2012-12-19 最終更新日 2017-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.85 Å) 主引用文献 On the reproducibility of protein crystal structures: five atomic resolution structures of trypsin. Acta Crystallogr.,Sect.D, 69, 2013
1PQ5	Trypsin at pH 5, 0.85 A 分子名称: ARGININE, SULFATE ION, Trypsin 著者 Schmidt, A, Jelsch, C, Rypniewski, W, Lamzin, V.S. 登録日 2003-06-18 公開日 2003-11-11 最終更新日 2017-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.85 Å) 主引用文献 Trypsin Revisited: CRYSTALLOGRAPHY AT (SUB) ATOMIC RESOLUTION AND QUANTUM CHEMISTRY REVEALING DETAILS OF CATALYSIS. J.Biol.Chem., 278, 2003
5MNN	Cationic trypsin in complex with N-amidinopiperidine (deuterated sample at 100 K) 分子名称: CALCIUM ION, Cationic trypsin, SULFATE ION, ... 著者 Schiebel, J, Heine, A, Klebe, G. 登録日 2016-12-13 公開日 2018-01-17 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.859 Å) 主引用文献 Intriguing role of water in protein-ligand binding studied by neutron crystallography on trypsin complexes. Nat Commun, 9, 2018
5AVD	The 0.86 angstrom structure of elastase crystallized in high-strength agarose hydrogel 分子名称: Chymotrypsin-like elastase family member 1, SULFATE ION 著者 Sugiyama, S, Shimizu, N, Maruyama, M, Sazaki, G, Adachi, H, Takano, K, Murakami, S, Inoue, T, Mori, Y, Matsumura, H. 登録日 2015-06-15 公開日 2015-07-08 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.86 Å) 主引用文献 Growth of protein crystals in hydrogels prevents osmotic shock J.Am.Chem.Soc., 134, 2012
5MNG	Cationic trypsin in complex with benzamidine (deuterated sample at 100 K) 分子名称: BENZAMIDINE, CALCIUM ION, Cationic trypsin, ... 著者 Schiebel, J, Heine, A, Klebe, G. 登録日 2016-12-13 公開日 2018-01-17 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.86 Å) 主引用文献 Intriguing role of water in protein-ligand binding studied by neutron crystallography on trypsin complexes. Nat Commun, 9, 2018
5DJ7	S. erythraea trypsin acyl-enzyme 分子名称: Trypsin 著者 Blankenship, E, Lodowski, D.T. 登録日 2015-09-01 公開日 2017-03-08 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.87 Å) 主引用文献 High resolution structures of S. erythraeus trypsin throughout the catalytic cycle To be Published
4I8J	Bovine trypsin at 0.87 A resolution 分子名称: BENZAMIDINE, CALCIUM ION, Cationic trypsin, ... 著者 Dauter, Z, Liebschner, D, Dauter, M, Brzuszkiewicz, A. 登録日 2012-12-03 公開日 2012-12-19 最終更新日 2013-09-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.87 Å) 主引用文献 On the reproducibility of protein crystal structures: five atomic resolution structures of trypsin. Acta Crystallogr.,Sect.D, 69, 2013
4I8L	Bovine trypsin at 0.87 resolution 分子名称: BENZAMIDINE, CALCIUM ION, Cationic trypsin, ... 著者 Dauter, Z, Liebschner, D, Dauter, M, Brzuszkiewicz, A. 登録日 2012-12-03 公開日 2012-12-19 最終更新日 2017-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.87 Å) 主引用文献 On the reproducibility of protein crystal structures: five atomic resolution structures of trypsin. Acta Crystallogr.,Sect.D, 69, 2013
2H5D	0.9A resolution crystal structure of alpha-lytic protease complexed with a transition state analogue, MeOSuc-Ala-Ala-Pro-Val boronic acid 分子名称: ALPHA-LYTIC PROTEASE, GLYCEROL, MEOSUC-ALA-ALA-PRO-ALA BORONIC ACID INHIBITOR, ... 著者 Fuhrmann, C.N, Agard, D.A. 登録日 2006-05-25 公開日 2006-09-26 最終更新日 2023-11-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (0.9 Å) 主引用文献 Subangstrom crystallography reveals that short ionic hydrogen bonds, and not a His-Asp low-barrier hydrogen bond, stabilize the transition state in serine protease catalysis J.Am.Chem.Soc., 128, 2006

 

12345678910111213141516>