4UV9

LSD1(KDM1A)-CoREST in complex with 1-Ethyl-Tranylcypromine

GO（遺伝子オントロジー）由来の情報

鎖名	GO（遺伝子オントロジー）id	名前空間	内容
A	0005634	cellular_component	nucleus
A	0006355	biological_process	regulation of DNA-templated transcription
A	0016491	molecular_function	oxidoreductase activity
A	0050660	molecular_function	flavin adenine dinucleotide binding
B	0000118	cellular_component	histone deacetylase complex
B	0003682	molecular_function	chromatin binding
B	0003714	molecular_function	transcription corepressor activity
B	0005515	molecular_function	protein binding
B	0005634	cellular_component	nucleus
B	0005654	cellular_component	nucleoplasm
B	0005667	cellular_component	transcription regulator complex
B	0006325	biological_process	chromatin organization
B	0006357	biological_process	regulation of transcription by RNA polymerase II
B	0010629	biological_process	negative regulation of gene expression
B	0017053	cellular_component	transcription repressor complex
B	0019899	molecular_function	enzyme binding
B	0030218	biological_process	erythrocyte differentiation
B	0045654	biological_process	positive regulation of megakaryocyte differentiation
B	0045892	biological_process	negative regulation of DNA-templated transcription
B	1990391	cellular_component	DNA repair complex

PDBデータベースに由来する情報

site_id	AC1
残基数	34
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE D70 A 900

鎖名	残基
A	GLY285
A	GLY315
A	ARG316
A	LEU329
A	GLY330
A	ALA331
A	MET332
A	VAL333
A	PHE538
A	THR588
A	ALA589
A	GLY287
A	VAL590
A	THR624
A	LEU625
A	PRO626
A	VAL637
A	TRP751
A	TRP756
A	SER760
A	TYR761
A	GLY800
A	VAL288
A	GLU801
A	ALA809
A	THR810
A	VAL811
A	ALA814
A	SER289
A	LEU307
A	GLU308
A	ALA309
A	ARG310
A	GLY314

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SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報

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残基数	1
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鎖名	残基	詳細
B	ARG127
A	GLU308
A	ARG310
A	ARG316
A	MET332
A	GLU801
A	THR810

---

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残基数	1
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鎖名	残基	詳細
B	GLU260

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鎖名	残基	詳細
B	ASN460

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残基数	4
詳細	CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO2) => ECO:0007744|PubMed:28112733

鎖名	残基	詳細
B	ARG122
B	LYS297
B	GLU466

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鎖名	残基	詳細
A	SER111

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残基数	1
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鎖名	残基	詳細
A	TYR115

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鎖名	残基	詳細
A	SER117

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鎖名	残基	詳細
A	SER146

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残基数	3
詳細	MOD_RES: N6-acetyllysine => ECO:0000269|PubMed:27292636

鎖名	残基	詳細
A	LYS432
A	LYS433
A	LYS436

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残基数	1
詳細	MOD_RES: Phosphoserine => ECO:0007744|PubMed:23186163

鎖名	残基	詳細
A	SER611

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残基数	1
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鎖名	残基	詳細
A	SER849

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site_id	SWS_FT_FI12
残基数	2
詳細	CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in SUMO2) => ECO:0007744|PubMed:28112733

鎖名	残基	詳細
A	LYS442
A	LYS469

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site_id	SWS_FT_FI13
残基数	2
詳細	CROSSLNK: Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) => ECO:0000305|PubMed:25018020

鎖名	残基	詳細
A	LYS503

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