load ftp 2onk |
PDBエントリー"2ONK"のファイルを読み込む（→load コマンド参照）。
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wireframe off |
ワイヤーフレーム表示された全体を消す（→wireframe コマンド参照）。
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select *:c | *:d |
c鎖とd鎖を全て選択。"|" は 「または」(or)の意味（→頂点表現参照）。 |
| [Display]-[Cartoon] | 選択範囲を太いリボン表現にする（→[Display]-[Cartoon]参照）。 |
color skyblue |
選択範囲を水色にする（→color コマンド参照）。
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select *:e |
e鎖を全て選択 |
| [Display]-[Cartoon] | 選択範囲を太いリボン表現にする。 |
color red |
選択範囲を赤色にする。 |
select hetero |
へテロ分子（リガンドや水など、既定の原子表現参照）のみを全て選択 |
| [Display]-[Spacefill] | 選択しているものを空間充塡表現（→[Display]-[Spacefill]）で表示。 |
| （原子をクリック） |
前項で表現を変更した原子の情報を取得。原子IDはグループ名の後に表示されている数値（701）。 Atom: W 4.183 Group: WO4 701 Model: 1 File: 1 |
| [Display]-[Wireframe] | 選択範囲をワイヤーフレーム表現にする。 |
wireframe off |
選択範囲中（ヘテロ分子全て）のワイヤーフレーム表示された部分を消す。 |
select 701 & !MG |
目的のヘテロ原子を選択。 この場合、701グループに含まれるものからMG（マグネシウム原子）を除いたものを指定。 "&" は 「かつ」(and)、"!" 「否定」(not)を示す （→頂点表現参照）。 |
| [Display]-[Spacefill] | 選択しているものを空間充塡表現で表示。 |
color gold |
選択範囲を金色にする。 |
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select 88-107:c | 88-107:d |
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| c鎖とd鎖の88〜107番残基を選択。 | |
color green |
選択範囲を緑色にする。 |
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