PDBETAのダウンロード

本ソフトウェアを使用、複製、または配布すると同時に、利用者が本契約書を理解し、そのすべてに同意いただいたものとします。本契約書の条項に同意されない場合は、本ソフトウェアを使用、複製、または配布しないでください。本契約書の条項に同意されない場合は、本ソフトウェアのダウンロードを中止してください。

PDBETAおよびともに提供されるドキュメント等の関連資料（「本ソフトウェア」と記載します）は、輪湖博（早稲田大学）と猿渡茂（北里大学）（「著作権者」と記載します）によって開発されました。本ソフトウェアに関する著作権等の知的財産権は、コピーされたものも含め、著作権者に帰属し、著作権法およびその他関連して適用される法律等によって保護されています。

本使用許諾契約書（「本契約書」と記載します）に基づいて提供する本ソフトウェアを使用する非独占的な権利を、非営利目的の場合に限って、下記条項に基づき許諾します。利用者は、

(a) 利用者が所有するいかなるコンピュータ上でも本ソフトウェアを使用することができます。

(b) 個人的利用を目的としてのみ、本ソフトウェアのコピーを作成することができます。

(c) いかなる修正および追加をしないオリジナルな状態でのみ、本ソフトウェアを再配布することができます。

もし本ソフトウェアの使用が科学的論文の発表等に寄与した場合には、その中で、利用者は著作権者への謝辞を述べ、本ソフトウェアを記述した文献を引用しなければなりません。

本ソフトウェアを再配布するときはいつでも、受取人もまた本契約書のすべてに同意していただく必要があります。受取人も、本ソフトウェアを使用、複製、または配布すると同時に、本契約書のすべてに同意いただいたものといたします。

本ソフトウェアはその品質や実行性能等に関していかなる保証もない”そのまま”の形で提供されています。本ソフトウェアに不具合その他の瑕疵が存在した場合でも、著作権者は何らの保証もいたしません。本ソフトウェアの利用により、万が一ハードウェア機器もしくはデータ等に支障が生じた場合でも、著作権者は一切その責任を負いません。上記の他、本ソフトウェアの利用によって何らかの損害が生じた場合でも、著作権者は一切その責任を負いません。

上記受諾契約書に書かれた事項を

PDBデータの二次構造の同定にDSSP [1]を利用することができます。下記サイトよりWindows用あるいはLinux用の実行ファイルをダウンロードして、PDBETAの中のフォルダーあるいはディレクトリーbinに置いてください。

DSSPをダウンロードされなくても構いません。binにDSSPの実行ファイルがなければ、PDBETAは自動的にPDBデータ内に記載された二次構造情報を利用します。

[1] W. Kabsch and C. Sander, Dictionary of protein secondary structure: pattern recognition of hydrogen-bonded and geometrical features. Biopolymers 22 (1983) 2577-2637.