構造の重ね合わせ

構造の重ね合わせ（structural superposition）とは、他の構造との類似度合いをみるために、分子を回転したり移動したりすることを指します。 元々の定義は構造の類似度合いを指標化したもので、 最適な重ね合わせとはこの類似度合いの尺度を最大化するものです。 構造の重ね合わせの代わりに、二乗平均偏差（ RMSD ）のような別の尺度で重ね合わせを定義することもできます。 この場合、最適な重ね合わせはRMSDを最小化したものになります。 ASH プログラムは、 NER スコアによる前者の方針を使ったものです。