「ペプチド鎖」と「水を除く低分子」の両方を含むエントリーのPDBIDを得る
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SELECT DISTINCT b.pdbid FROM brief_summary b LEFT JOIN entity e1 ON b.pdbid=e1.pdbid LEFT JOIN pdbx_nonpoly_scheme e2 ON e1.pdbid=e2.pdbid AND e1.id=e2.entity_id WHERE ('{1,2}' && b.chain_type_ids) AND e1.type='non-polymer' AND NOT (e2.mon_id = ANY(array['HOH','DOD']))
主要項目テーブルbrief_summaryでは 選択可能な高分子鎖の種別名を番号に置き換えてchain_type_idsカラムに保存しています。対応については構成要素情報をご覧ください。
作成日: 2018-12-10 (最終更新日: more than 1 year ago)






