各Chemical Component IDの分子名、分子式、化学式量、InChIKeyを得る

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PDBエントリーに現れるすべての化合物にはPDBで規定した独自のIDChemical Component IDが割り振られています。 PDBj Mineのデータベースに問い合わせることでChem Comp IDと化合物に関する他の情報との関係を得ることができます。

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SELECT c.id, c.name, c.formula, c.formula_weight, d.descriptor AS "InChIKey"
FROM cc.chem_comp c
JOIN cc.pdbx_chem_comp_descriptor d ON d.comp_id = c.comp_id
WHERE d.type = 'InChIKey'

要素	内容
cc.chem_comp
cc.chem_comp.id	Chemical Component ID
cc.chem_comp.formula	分子式
cc.chem_comp.formula_weight	化学式量
cc.pdbx_chem_comp_descriptor	化合物の構造に関する情報を記したテーブル
cc.pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id	cc.chem_comp.id（= Chemical Component ID）を指す値
cc.pdbx_chem_comp_descriptor.type	descriptorを導き出すのに使われたプログラムやライブラリの名前
cc.pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor	化合物についての説明、IDなど

テーブルの各構成要素の詳細については、Mine 2 関係データベースに関する文書をご覧ください。