GO IDが0006220(ピリミジンヌクレオチド代謝過程)である、PDB IDとUniProtアクセッションコード一覧を得る
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SELECT DISTINCT e.pdbid, e.entity_id, s.sp_primary FROM entity_poly AS e JOIN sifts.pdb_chain_go AS s ON s.pdbid = e.pdbid AND s.chain = ANY(STRING_TO_ARRAY(e.pdbx_strand_id,',')) WHERE s.go_id = 'GO:0006220'
| 要素 | 内容 |
|---|---|
| entity_poly.entity_id | エントリー内に含まれる高分子の種類を識別するためのID(entity ID) |
| sifts.pdb_chain_go.chain | GO IDと「PDBID+Chain ID」との対応情報テーブル「sifts.pdb_chain_go」におけるChainID(=atom_site.auth_asym_id) |
| sifts.pdb_chain_go.sp_primary | GO IDと「PDBID+Chain ID」との対応情報テーブル「sifts.pdb_chain_go」におけるGO ID |
作成日: 2018-05-08 (最終更新日: more than 1 year ago)






