PDBエントリー1babに含まれる各高分子鎖のentity ID、Chain ID(auth_asym_id)、UniProt IDを得る
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SELECT e.pdbid, e.entity_id, s.chain, s.sp_primary FROM entity_poly AS e JOIN sifts.pdb_chain_uniprot AS s ON s.pdbid = e.pdbid AND s.chain = ANY(STRING_TO_ARRAY(e.pdbx_strand_id,',')) WHERE e.pdbid='1bab'
| 要素 | 内容 |
|---|---|
| entity_poly.entity_id | エントリー内に含まれる高分子の種類を識別するためのID(entity ID) |
| entity_poly.pdbx_strand_id | 各entity IDに対応する分子(鎖)のChain ID(=atom_site.auth_asym_id)をすべてコンマ区切りで記した値 |
| sifts.pdb_chain_uniprot.chain | Chain ID(=atom_site.auth_asym_id) |
| sifts.pdb_chain_uniprot.sp_primary | UniProt ID |
作成日: 2018-04-27 (最終更新日: more than 1 year ago)






