PDBエントリー1bbtの生物学的単位生成情報を得る

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SELECT e1.assembly_id, e1.asym_id_list, e1.oper_expression,
e2.oligomeric_details, e2.oligomeric_count
FROM pdbx_struct_assembly_gen AS e1
LEFT JOIN pdbx_struct_assembly AS e2
ON e1.pdbid=e2.pdbid AND e1.assembly_id=e2.id
WHERE e1.pdbid='1bbt'

要素	内容
pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id	生物学的単位識別ID、pdbx_struct_assembly.idの値に対応
pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list	変換を適用する対象となる鎖のID（auth_asym_id）をコンマ区切りで記した値
pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression	適用する変換の変換ID（oper_id）をコンマ区切り、区間指定などで記した値。pdbx_struct_oper_list.idに対応。
pdbx_struct_assembly.oligomeric_details	生成される生物学的単位に関する説明。
pdbx_struct_assembly.oligomeric_count	生成される生物学的単位に含まれる高分子鎖の数。

参考文献

作成日: 2018-04-27 (最終更新日: more than 1 year ago)