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PDBj RESTサービスでご利用いただけるファイルフォーマット

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Fetch APIファイルフォーマット

以下は、PDBファイルをダウンロード/表示するためのRESTサービスでご利用いただけるファイルフォーマットの一覧です。
mmcifPDBx/mmcifフォーマットによるPDB data (noatom+atom)
mmjson-allmmjsonフォーマットによるPDBデータ (noatom+atom)
mmjson-noatom mmjsonフォーマットによるPDBデータ (noatom)
mmjson-plusmmjsonフォーマットによるPDBデータ (plus)
pdbml-allPDBMLフォーマットによるPDBデータ (noatom+atom)
pdbml-noatomPDBMLフォーマットによるPDBデータ (noatom)
pdbml-extatomXMLフォーマットによるPDBデータ (extatom)
rdfRDF formatによるPDBデータ (noatom)
sfPDBx/mmcifフォーマットによるPDB構造因子データ
bu-cifPDBx/mmcifフォーマットによるPDB生物学的単位構造データ
val-mmcifPDBx/mmcifフォーマットによる検証レポートデータ
val-xmlXMLフォーマットによる検証レポートデータ
val-pdf-fullPDFフォーマットの完全検証レポート(full)
val-pdfPDFフォーマットの検証レポート
val-svgSVGフォーマットの検証結果グラフ
val-pngPNGフォーマットの検証結果グラフ
2fo-fc-cifPDBx/mmcifフォーマットの2fo-fc マップ
fo-fc-cifPDBx/mmcifフォーマットのfo-fc マップ
2fo-fc-mtzMTZフォーマットの2fo-fc マップ
fo-fc-mtzMTZフォーマットのfo-fc マップ
2fo-fc-ccp4CCP4フォーマットの2fo-fc マップ
fo-fc-ccp4CCP4フォーマットのfo-fc マップ
pdbレガシーフラットファイル(PDBフォーマット)のPDBデータ
buレガシーフラットファイル(PDBフォーマット)のPDB生物学的単位構造データ
pdb-bundlePDBフォーマット変換不可エントリーのベストエフォートPDBフォーマットファイル(複数のファイル)
nmr-uni-starNMR-STARフォーマットのNMRデータ
nmr-uni-nefNEFフォーマットのNMRデータ
nmr_csNMR-STARフォーマットのNMR化学シフトデータ
nmr_v2NMR-STARフォーマットのNMR距離制限データ
nmrフラットファイルフォーマットのNMR距離制限データ
fastafastaフォーマットの配列情報

検索結果ファイルフォーマット

以下は、各種検索APIで、ダウンロード/表示するためのRESTサービスでご利用いただけるファイルフォーマットの一覧です。
csvカンマで区切られた値
tsvタブで区切られた値
json'JavaScript Object Notation'の略で、軽量にデータをややりとりするフォーマットで、JavaScriptの一部に基づいています。
jsonpscriptタグを使用してクロスドメインなデータを取得する仕組み(HTMLのscriptタグ、JavaScript、JSONを組み合わせて実現される)

作成日: 2014-08-25 (最終更新日: more than 1 year ago)2021-07-02

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件を2025-04-30に公開中

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