entity.typeでは各エンティティー(分子種)ごとにpolymer/non-polymerなどの分子タイプが規程されていますが、その判断基準はどのようになっているでしょうか? - FAQ
Q) entity.typeでは各エンティティー(分子種)ごとにpolymer/non-polymerなどの分子タイプが規程されていますが、その判断基準はどのようになっているでしょうか?
A) 現在、ペプチド鎖の場合は3残基以上、核酸の場合は2塩基以上の分子についてpolymerと規程し登録処理を行っています。ただし、古いPDBエントリーの中にはこの基準に適合しない記述がみられるものもあります。
また糖鎖については現状各糖単位を別々の分子としnon-polymerと規程していますが、近日次のように規程を見直しデータを一括修正する予定です。
[質問一覧に戻る]作成日: 2020-01-17 (最終更新日: more than 1 year ago)