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Q) FTPを使って、PDBデータを指定したフォーマット(PDB,mmCIF,XML)でダウンロードする方法を教えて下さい

A) FTPサイトの下記ディレクトリ配下に、フォーマット別にディレクトリを分けてデータを収めています。

ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/data/structures/divided/

  • pdb/ … PDBフォーマット
  • mmCIF/ … mmCIFフォーマット

XMLフォーマットは、必要とするデータに応じて下記の3つのディレクトリからデータをダウンロードして下さい。

  • XML/ … 全てのデータ (ヘッダ+原子座標)
  • XML-extatom/ … 原子座標部のみ
  • XML-noatom/ … ヘッダ情報(原子座標部分を除いたもの)
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2015-01-30 (last edited: more than 1 year ago)2016-03-03
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