二次データベース

eF-site

eF-site （エフサイト）は蛋白質の機能部位に関する電子表面形状を見るためのデータベースです。活性部位のコノリー表面（Connolly surface）上に静電ポテンシャルと疎水性を表示します。分子認識機構の解析に用いることができます。

URL: https://pdbj.org/eF-site/

eF-seek

eF-seek （エフシーク）は似たリガンド結合部位を検索するウェブサービスです。eF-siteデータベースの代表結合部位を、クリーク検索アルゴリズム（clique search algorithm）に基づく独自の方法で検索します。

URL: https://pdbj.org/eF-seek/top.do

eF-surf

eF-surf （エフサーフ）は分子の静電ポテンシャルと分子表面を計算して作成するウェブサービスです。

URL: https://pdbj.org/eF-surf/top.do

ProMode Elastic

ProMode Elastic （プロモードエラスティック）はプログラムPDBETA（Elastic-network-model based normal mode analysis in Torsional Angle space for PDB data、二面角を独立変数とする弾性ネットワークモデルによる基準振動解析計算プログラム）を使ってPDBデータの基準振動解析を行った結果のデータベースです。

URL: https://pdbj.org/promode-elastic/