6-1) 非標準残基や修飾残基を含むアミノ酸配列を登録する方法を教えてください。- wwPDB D&A FAQ -

登録者は、完全なアミノ酸配列についての情報を提供する必要があります。 最終段階の座標ファイルには含まれなかった発現タグや、他の観測されない領域も、配列に含めてください。

標準アミノ酸を含むポリペプチド鎖に対しては、ポリマー鎖に含まれる全ての標準アミノ酸を一文字表記で表したアミノ酸配列を登録してください（例：GLU -> E）

同様に、核酸配列に対しても、ポリマー鎖に含まれる標準ヌクレオチドは一文字表記で表してください（例：Uracil -> U）。 標準アミノ酸と核酸の一文字表記の一覧を参考にしてください。

ポリマー鎖が非標準アミノ酸や非標準ヌクレオチドを含む場合、座標で使用されるものと同じ３文字表記の残基名を括弧で囲んで登録してください。 （例：座標の表記がMSEの場合、(MSE)）

修飾残基を含むアミノ酸配列の例：
VQDKTT(MSE)ELFISEKTV

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