5-8j) 登録構造中のリガンドが、化合物辞書（CCD）に登録されていないリガンドの場合、好きなIDを指定できますか？- wwPDB D&A FAQ -

リガンドIDは、登録者が指定できるものではなく、アノテーション処理の過程で決定されます。登録構造のリガンドが、未公開のものも含めて化合物辞書（CCD）に登録されておらず、登録者が希望するIDが使用されていなければ、そのままのIDで登録される可能性があります。