5-5j) リガンドの特定処理において、ミスマッチを指摘されています。どうすれば良いですか？- wwPDB D&A FAQ -

化合物辞書(CCD)に登録済みのリガンドIDが登録構造中のリガンドで使用され、構造が完全には一致しない場合、ミスマッチが指摘されます。 「選択したリガンドを調べる（Inspect Selected Ligands）」を選択後、提案される選択肢の中から適切なものを選択してください。

• 登録構造中のリガンドの構造は、CCDの定義通りである場合・・・“Use originally proposed ID of YYY”　（ここでYYYはCCDに定義され、登録構造にも含まれるリガンドID）
• 登録構造中のリガンドは、CCDに登録済みの別のIDを持つリガンドと一致する場合・・・“Use exact match ID of XXX instead of originally proposed ID”　（ここでXXXは提案されたリガンドID）
• 登録構造中のリガンドがCCDに登録されておらず、新しいリガンドとして登録する場合・・・“Provide us with information about the ligand”

その後、「保存（Save）」ボタンを押し、リガンドについての確認が全て終われば、「終了（Finish (all issues are addressed)）」を選択してください。

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