3-2) PDBフォーマットのファイルをPDBxフォーマットのファイルに変換する方法を教えてください。 - wwPDB D&A FAQ -

新しい登録システムでは、PDBフォーマットでアップロードされたファイルは、自動的にPDBx/mmCIFフォーマットに変換されます。アップロードしたPDBフォーマットファイルと変換後のPDBx/mmCIFフォーマットファイルは、左側パネルの最下部にあるリンク"Download files"からダウンロードできます。

あるいは、登録前にPDBフォーマットのファイルをPDBxフォーマットに変換したい場合は、pdb_extractを使用して変換し登録用のファイルを準備することもできます。