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[化学シフト]

2010年12月6日より、NMRによって解析された構造を登録する際には、化学シフトの登録が必須となっています。

登録時には、 NMR-STAR v3.1形式の化学シフトファイルと座標ファイル内の原子の命名法が矛盾していないかが検証されます。
登録前に化学シフトを事前チェックするためには、PDBj-BMRBの検証サービスをご利用頂けます。
http://bmrb.pdbj.org/validate/

公開済みの化学シフトファイルは、PDB IDの中間の2文字でグループ分けされ、FTPサーバの下記のディレクトリ配下に格納されています。
ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/data/structures/divided/nmr_chemical_shifts/
公開済みの全てのファイルは、下記の単一ディレクトリにシンボリックリンクされています
ftp://ftp.pdbj.org/pub/pdb/data/structures/all/nmr_chemical_shifts/

詳細については、 wwPDBニュース をご覧ください

また、NMR-STARフォーマットの詳細は、下記をご参照下さい。

NMR-STARフォーマット
http://bmrb.pdbj.org/formats.html (英語)

NMR-STAR 3.1のディクショナリ
http://bmrb.pdbj.org/dictionary/3.1html/SuperGroupPage.html(英語)

作成日: 2012-09-07 (最終更新日: more than 1 year ago)2013-11-05